Introdução ao R para análise de dados em Psicologia

Francisco Pablo Huascar Aragão Pinheiro

Quem sou eu

• Psicólogo (UFC)
• Mestre em Psicologia (UFC)
• Doutor em educação (UFC)
• Professor do campus Sobral da UFC
• Recentemente, um entusiasta do R

Meu currículo lattes: acesse aqui

Por que usar o R?

• Gratuito
• Pesquisa reprodutível (para outros cientistas e o seu eu do futuro)
• Flexível
• Milhares de funções para todo tipo de análise
  • Novos funções são desenvolvidas o tempo todo ao redor do mundo

O que eu preciso saber para participar desse minicurso?

• Criar e navegar entre pastas
• Abrir arquivos
• Criar arquivos etc.

Estatística

• Medidas de tendência central e dispersão

• Anova e Teste T

• Correlação

• Regressão

Eu tenho que aprender uma linguagem de programação para usar o R?

Sim, mas é como aprender um novo idioma: há desconforto inicial, mas, com a prática, é possível se tornar fluente!

E o tidyverse facilita muito esse aprendizado

R

R Studio

Vamos começar!

Criação de um projeto - Passo 1

Criação de um projeto - Passo 2

Criação de um projeto - Passo 3

Criação de um projeto - Passo 4

• É muito importante que todos os arquivos do projeto fiquem dentro de uma mesma pasta
• A pasta “raiz” não pode conter caracteres especiais
• Dica: crie seus projetos dentro da pasta “documentos” do Windows (ou em uma subpasta “projetos” dentro da pasta “documentos”)

E você vai chegar aqui

Criando o seu primeiro Script

Paineis do R Studio

Ajuste dos paineis

Source Code

É onde o código é escrito. Vários tipos de arquivos podem ser utilizados: Scripts, Rmarkdown etc.

Console

Mostra a saída do que é feito no source code. Também pode ser usado para escrever códigos, mas não é possível salvá-los

Environment/History

No environment estão os diversos objetos que são criados pelo código: vetores, dataframes (bancos de dados), tibbles etc.

File/Plots/Packages/Help

Neste painel são mostrados os arquivos do projeto, os gráficos produzidos, a ajuda e informações sobre os pacotes (instalar, ativar, desativar etc).

File/Plots/Packages/Help

Cheat Sheets

R for Data Science

Livro base para o mini curso

R for Data Science

• Neste link você pode acessar a primeira edição do livro:

https://r4ds.had.co.nz/

• E aqui você pode acessar a segunda edição que ainda está sendo finalizada:

https://r4ds.hadley.nz/

Estes slides tem como base o conteúdo da segunda edição

3 Fluxo de trabalho: básico

3.1 Noções básicas de codificação

Execução de códigos no Script

• Atalho de de teclado: ctrl + enter

Cálculos matemáticos básicos

10+10

[1] 20

10/2

[1] 5

10*2+5

[1] 25

10-3

[1] 7

10^2

[1] 100

sqrt(100)

[1] 10

Exercícios

• Divida 250 por 10
• Eleve 11 ao quadrado
• Multiplique 10 por 2 e some 5
• Subtraia 10 de 20 e divida por 10
• Some 40 e 50 e multiplique por 10

Respostas

250/10

[1] 25

11^2

[1] 121

10*2+5

[1] 25

(20-10)/10

[1] 1

(40+50)/10

[1] 9

Criação de objetos com o operador de atribuição <-

x <- 3
x

[1] 3

y <- 10*10
y

[1] 100

• O valores de x ou y não são impressos; apenas armazenados.
• Para visualizar o valor de um objeto, execute-o no script.

Todas as instruções de atribuição têm o mesmo formato

nome_do_objeto <- "valor"

nome_do_objeto

[1] "valor"

• Ao ler esse código, diga: “o nome do objeto obtém valor”
• Atalho de teclado do R Studio: Alt + “-” (sinal de menos)

Exercícios

Crie os seguintes objetos:

• a com valor 2
• b com valor 10
• c com valor 5
• d com valor 10*2

Respostas

a <- 2
a

[1] 2

b <- 10
b

[1] 10

c <- 5
c

[1] 5

d <- 10*2
d

[1] 20

As operações podem ser realizadas entre objetos

a*b

[1] 20

a+b

[1] 12

a/b

[1] 0.2

a-b

[1] -8

Exercícios

• Divida c por d e some a
• Some a e b e divida por c
• Multiplique a por b e some d
• Some c com d e divida por a

Respostas

(c/d) + a

[1] 2.25

(a+b)/c

[1] 2.4

(a*b)+d

[1] 40

(c+d)/a

[1] 12.5

É possível combinar múltiplos elmentos em um vetor com c() - “concatenar”

z <- c(1,2,10,12)
z

[1]  1  2 10 12

w <- c(3,5,6,8)
w

[1] 3 5 6 8

Aritimética básica nos vetores é aplicada a cada elemento do vetor

z

[1]  1  2 10 12

z*2

[1]  2  4 20 24

w

[1] 3 5 6 8

w*3

[1]  9 15 18 24

Também é possível realizar operações com vetores

z+w

[1]  4  7 16 20

z-w

[1] -2 -3  4  4

z-w^2

[1]  -8 -23 -26 -52

Exercícios

• Crie os vetores z <- c(1,2,10,12) e w <- c(3,5,6,8)
• Eleve z ao quadrado
• Some 10 a w
• Divida z por 3
• Multiplique z e w
• Divida z por w

Respostas

z <- c(1,2,10,12)
z

[1]  1  2 10 12

w <- c(3,5,6,8)
w

[1] 3 5 6 8

z^2

[1]   1   4 100 144

w+10

[1] 13 15 16 18

z/3

[1] 0.3333333 0.6666667 3.3333333 4.0000000

z+w

[1]  4  7 16 20

z/w

[1] 0.3333333 0.4000000 1.6666667 1.5000000

Dica 1

• O R diferencia MAIÚSCULAS de minúsculas (case sensitive)

a <- letters

A

Error: object 'A' not found

a <- letters

a

 [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j" "k" "l" "m" "n" "o" "p" "q" "r" "s"
[20] "t" "u" "v" "w" "x" "y" "z"

Dica 2

• Cuidado com erros de digitação

data("cars")

carz

Error: object 'carz' not found

Cars

data("cars")

cars 

   speed dist
1      4    2
2      4   10
3      7    4
4      7   22
5      8   16
6      9   10
7     10   18
8     10   26
9     10   34
10    11   17
11    11   28
12    12   14
13    12   20
14    12   24
15    12   28
16    13   26
17    13   34
18    13   34
19    13   46
20    14   26
21    14   36
22    14   60
23    14   80
24    15   20
25    15   26
26    15   54
27    16   32
28    16   40
29    17   32
30    17   40
31    17   50
32    18   42
33    18   56
34    18   76
35    18   84
36    19   36
37    19   46
38    19   68
39    20   32
40    20   48
41    20   52
42    20   56
43    20   64
44    22   66
45    23   54
46    24   70
47    24   92
48    24   93
49    24  120
50    25   85

3.2 Comentários

R irá ignorar qualquer texto após # para essa linha.

# Criação de um vetor com os 5 primeiros números pares

pares <- c(2,4,6,8,10)

pares

[1]  2  4  6  8 10

# Elevando os pares ao quadrado

(pares)^2

[1]   4  16  36  64 100

Uso dos comentários: Demarcar seções do no código

• Código
• Gráfico

# Obtenção dos dados

penguins <- penguins

# Gráficos

penguins |> 
  filter(!is.na(sex)) |> 
  ggplot(aes(flipper_length_mm, 
             bill_length_mm, 
             color = sex,
             size = body_mass_g)) +
  geom_point(alpha = 0.5) +
  facet_wrap(~species) 

Outro uso dos comentários: explicações

• Use comentários para explicar o porquê do seu código, não o como ou o quê
• O que e como do seu código são sempre possíveis de descobrir
• Descobrir por que algo foi feito é muito mais difícil

Sem explicações para a equipe

penguins |> 
  filter(island == "Biscoe",
         !is.na(sex)) |>
  ggplot(aes(flipper_length_mm, 
             bill_length_mm, 
             color = sex, 
             size =body_mass_g)) +
  geom_point(
    alpha = 0.5
    ) +
  facet_wrap(~ species)

Sem explicações para a equipe

Com explicações para a equipe

# O relatório 3 só precisava dos 
#dados da ilha Biscoe
penguins |> 
  filter(island == "Biscoe",
         !is.na(sex)) |>
  ggplot(aes(flipper_length_mm, 
             bill_length_mm, color = sex, 
             size = body_mass_g)) +
  geom_point(
    alpha = 0.5
    ) +
  facet_wrap(~ species)

Com explicações para a equipe

3.3 O que é um nome?

• Os nomes dos objetos devem começar com uma letra
• Podem conter apenas letras, números, _ e .
• Os nomes de seus objetos devem ser descritivos
• Sugerimos a seguinte convenção:
  • letras_minúsculas_separadas_com _

Exemplos de nomes

• i_use_snake_case
• otherPeopleUseCamelCase
• some.people.use.periods
• And_aFew.People_RENOUNCEconvention

Dica: auto completar

• Digite ao menos 3 caracteres e use a tecla tab
• O R Studio vai dar opções para escolher
• A função de auto completar é nossa amiga: use sempre!

3.4 Usando Funções

O R possui uma grande coleção de funções integradas que são chamadas desta maneira:

nome_da_funcao(argumento1 = valor1, argumento2 = valor2, ...)

Ao pressionar Tab dentro dos parênteses o R irá mostrar os argumentos disponíveis

Exemplo: Função seq()

Os dois primeiros argumentos da função seq são: from e to

# Crie uma sequência de números de 1 a 10
seq(from = 1, to = 10)

 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10

Terceiro argumento: by

# Agora, o incremento da sequência é por 2
seq(from = 1, to = 10, by = 2)

[1] 1 3 5 7 9

Se os valores dos argumentos estiverem na ordem da função, é possível omití-los

seq(1,10,2)

[1] 1 3 5 7 9

Exemplo: Função seq()

Ao explicitar os argumentos, eles podem aparecer em qualquer ordem:

seq(by = 2, to = 10, from = 1)

[1] 1 3 5 7 9

Porém, não será obitdo o mesmo resultado mudando os valores de lugar sem a explicitação dos argumentos

seq(2,10,1)

[1]  2  3  4  5  6  7  8  9 10

Como saber os argumentos e a função das funções?

?nome_da_funcao

help(nome_da_funcao)

args(nome_da_funcao)

Help

?seq

args()

args(rnorm)

function (n, mean = 0, sd = 1) 
NULL

Exercícios

• A partir da ajuda, descubra para que servem as funções a seguir e tente utilizá-las:
  • ls
  • round
  • rnorm

Funções básicas importantes

z <- c(2,2,6,11,9,20)
sum(z)

[1] 50

mean(z)

[1] 8.333333

median(z)

[1] 7.5

Funções básicas importantes

f <- c(2,2,6,11,9,20)
range(f)

[1]  2 20

min(f)

[1] 2

max(f)

[1] 20

quantile(f)

  0%  25%  50%  75% 100% 
 2.0  3.0  7.5 10.5 20.0 

Exercícios

• Use a função rnorm e crie um objeto chamado cem com cem casos, cuja média seja 30 e o desvio padrão 4
• Calcule as seguintes estatísticas do objeto cem:
  • Soma
  • Média
  • Desvio padrão
  • Mediana
  • Mínimo
  • Máximo
  • Quartis

Resposta - Parte 1

set.seed(123)

cem <- rnorm(n = 100, mean = 30, sd = 4)

hist(cem)

Resposta - Parte 2

sum(cem)

[1] 3036.162

mean(cem)

[1] 30.36162

sd(cem)

[1] 3.651264

median(cem)

[1] 30.24703

min(cem)

[1] 20.76332

max(cem)

[1] 38.74933

quantile(cem)

      0%      25%      50%      75%     100% 
20.76332 28.02458 30.24703 32.76728 38.74933 

Pacotes (packages)

• O que é um pacote?
  • Coleção de funções, objetos e documentação
  • Estendem as capacidades do R e adicionam novos recursos
  • Criados pela comunidade

Como instalar um pacote

install.packages("tidyverse")

• Só precisa ser feito uma vez
• Não coleque a instalação dos pacotes no script
  • Se o arquivo for compartilhado, não é legal modificar as configurações de outra pessoa

Como carregar o pacote

library(tidyverse)

• Precisa ser feito em cada novo script
• A cada novo uso do script
• Colocar todos os pacotes no início do script

Como obter informações sobre as funções do pacote

library(tidyverse)

?tidyverse

Exercícios

Instale os seguintes pacotes: tidyverse, car e psych

Resposta

install.packages("tidyverse")
install.packages("car")
install.packages("psych")

Exercícios

Carregue os pacotes que foram instalados anteriormente

library(tidyverse)
library(car)
library(psych)

Compartilhar conhecimento sempre!

O código e as imagens utilizados para a construção desse slide estão disponíveis no link a seguir:

https://github.com/pablo-huascar/rpsi